1、形态不同，绿毛藻比较细密且很短，丝藻相对来说就要粗扁一些2、颜色不同，绿毛藻颜色不是很深，丝藻的颜色是以翠绿色为主3、天敌不同，绿毛藻里面含有一些毒素，不常被鱼类食用，丝藻很容易被鱼类食用4、繁殖不同，绿毛藻是以无性生殖和有性生殖为主，丝藻以无性生殖居多。

1、形态不同

绿毛藻和丝藻的主要区别在于形态的不同，绿毛藻比较细密且很短，看起来比头发还要细，而丝藻相对来说就要粗扁一些，直径的宽度可达1～2mm，这也是可以用肉眼区别的。

2、颜色不同

同时它们的颜色也是不同的，绿毛藻颜色不是很深，看起来有点灰色，而丝藻的颜色是以翠绿色为主，具有很好的观赏价值，一般用于鱼缸的绿植居多，还能起到点缀的作用。

3、天敌不同

此外两者的天敌也是不同的，绿毛藻里面含有有一些毒素，所以鱼类是很少食用的，且生长速度快，长势好的话，看起来比较茂密，而丝藻很容易被鱼类食用。

4、繁殖不同

绿毛藻的形状丰富多样化，繁殖的方式也多种，主要是以无性生殖和有性生殖为主，而丝藻为单条丝状体，一般是以无性生殖居多，这也是两者最大的区别。